早在日據時代，小木殼船為旗津至高雄往返的交通工具。早期的旗津，唯一半島，也是高雄市人口最多、發展也最早，當時高雄市許多的民生物資均需至旗津採購，渡輪於是成為旗津與高雄的唯一橋樑。雖然過港隧道的建立，為旗津居民帶來往返便利，但渡輪仍是旗津的主要交通工具。
早期的旗津渡輪有一特色，因往返旗津均靠水運，旗津與高雄的婚嫁皆使用渡輪為禮車，常可見旗津輪渡站喜氣洋洋。旗津輪渡站在時間的衝擊下，已顯老態龍鍾，為了讓旗津顯現新的風貌，高雄市政府於八十七年規劃為旗 津輪渡站換著新裝，將輪渡站的外型改建為一復古建築，二樓為落地窗設計，可將高雄港磅礡海景盡收眼底。
